Post-doctorat chercheur en microbiologie (H/F)
Ifremer
Roscoff, Bretagne, FR
il y a 5h

Description de l'offre

La Station biologique de Roscoff (SBR) constitue un environnement scientifique et logistique idéal au développement du projet de l’équipe Génomique des Vibrios de par la présence des différentes plateformes technologiques auxquelles l’équipe a recours (bioinformatique, imagerie, cristallographie, service mer) et les projets de recherche fondamentaux développés dans les unités (écologie, biologie de microorganismes marins).

Réciproquement l’équipe enracine ses questions scientifiques et ses modèles expérimentaux dans les besoins de recherche appliquée que l’Ifremer doit mener (bactéries pathogènes d’huîtres).

Le poste s’intègre dans l’équipe du projet ERC advanced DYNAMIC qui vise à comprendre le rôle des phages dans la dynamique éco-évolutive de vibrios pathogènes d’huîtres creuses.

Sous la supervision de la responsable scientifique du projet, il / elle travaillera en étroite collaboration avec un / une technicien pour la partie expérimentale et un bioinformaticien pour la partie in silico.

Missions principales

Il / Elle sera en charge d'un objectif spécifique du projet DYNAMIC, qui est de comprendre les processus co-évolutifs des interactions entre les bactéries et les phages dans la nature.

Activités principales

  • Il / Elle sera en charge des séries temporelles d'échantillonnages consécutifs d'un site de la zone côtière atlantique française (juillet-août 2021 ;
  • juillet 22, 23), avec l’aide des collègues.

  • Isolation et stockage d'isolats de phages et de vibrios, tests d'infection croisée
  • Analyse du time shift et de l'adaptation locale
  • Métagénomique de la dynamique des phages
  • Analyse statistique
  • Participation aux tâches de l'équipe (par exemple, préparation des milieux de culture)
  • Il / Elle travaillera en collaboration étroite avec le CEFE - CNRS Montpellier pour l'analyse statistique. Cette collaboration se traduira par des séjours de courte durée à Montpellier et des échanges réguliers par visioconférence.

    Champs relationnel

  • En interne : Equipe du projet, (8 personnes), de l’unité LBI2M à Roscoff (100 personnes et de la station (350 personnes) diverses réunions et séminaires favoriseront les interactions.
  • Des échanges réguliers auront lieu avec l’unité PFOM Centre Ifremer Bretagne sites Plouzané / Argenton.

  • En externe (hors Ifremer et hors SBR) : CNRS CEFE Montpellier
  • Profil recherché

  • Thèse / PhD en microbiologie, microbiologie environnementale
  • Compétences mises en œuvre

    Compétences techniques / métiers

  • Connaissance de l'écologie et de l'évolution
  • Expertise solide dans l'analyse statistique et la gestion des données biologiques (y compris les données multivariées)
  • Qualités personnelles

  • Motivation pour le projet proposé
  • Rigueur et l'organisation des travaux produisant un grand ensemble de données
  • Désir d’apprendre, curiosité et adaptabilité
  • Capacité à travailler en équipe et à communiquer
  • Conditions de travail

  • Échantillonnage sur le terrain (juillet / août 2021 ; juillet 2022 et 23)
  • Travaux de laboratoire à la SBR (isolement, stockage de phages et de vibrions; tests d'infection croisée ; biologie moléculaire)
  • Courts séjours à Montpellier pour les analyses statistiques
  • Toutes nos candidatures sont traitées via notre site carrière. Pour plus de renseignements sur le poste, envoyez votre mail à Frederique.

    Le.Roux ifremer.fr , responsable scientifique du projet ERC advanced DYNAMIC.

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