Chercheur Post-Doctorant (H/F) Bio-Informaticien Structuraliste 6 mois renouvelable
CNRS
VALBONNE, Côte d'Azur
il y a 3j

Rémunération :

entre 2600 et 3800 bruts selon expérience

Niveau d'études souhaité : Doctorat

Expérience souhaitée : 5 à 10 années

Missions

Le projet concerne le développement d'une base de données pour le diagnostique / pronostique médical par la caractérisation multiplexée à haut débit des effets des variants du canal ionique ERG.

Dans ce projet collaboratif et rattachée au laboratoire de l'IPMC, la personne recrutée sera en charge de l'évaluation de l'impact des mutations de ce canal potassique sur sa structure protéique.

Le (la) candidat(e) sera en charge de la mise au point d'une approche bio-informatique pour l'analyse structurale du canal ERG, incluant un système de notation de l'impact de mutations génétiques de ce canal chez le patient.

A partir des données de cristallisation et d'outils informatiques disponibles en libre accès, il devra élaborer une approche méthodologique permettant son utilisation par des non-initiés dans un contexte clinique.

Activités

  • Prise en charge de la partie structurale du projet
  • Amélioration des outils existants
  • Automatisation de l'évaluation de score concernant l'impact des mutations sur la structure du canal ionique.
  • Veille scientifique pour l'amélioration de la significativité statistique de l'outil proposé
  • Présentation régulière de l'avancée de l'avancée du projet aux collaborateurs.
  • Compétences

    1. Maîtrise des logiciels requis pour l'analyse structural (pyMOL, UCSF CHimera, GENO3D, Alphafold ).

    2. Maîtrise de la programmation en R, PYTHON.

    3. Maitrise des fondamentaux de la chimie et des biostatistiques.

    4. Connaissance en biologie des protéines membranaires.

    Contexte de travail

    Poste à pourvoir au sein de l'Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (IPMC) (https : / / www.ipmc.cnrs.fr / cgi-bin / site.

    cgi). Cette unité mixte de recherche sous la double tutelle du CNRS et d'Université Côte d'Azur se situe sur le campus universitaire de Sophia-Antipolis sur la commune de Valbonne.

    Dans le cadre d'un projet financé par l'ANR (CarDiag) et en collaboration avec l'Institut du Thorax à Nantes, la personne recrutée travaillera au sein de l'équipe Physiologie et physiopathologie des canaux ioniques , dirigée par Florian Lesage, sous la responsabilité du Dr Franck Chatelain.

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